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Daniel Remondini

Professore ordinario

Dipartimento di Fisica e Astronomia "Augusto Righi"

Settore scientifico disciplinare: PHYS-06/A Fisica per le scienze della vita, l’ambiente e i beni culturali

Pubblicazioni

Menichetti, Giulia; Fariselli, Piero; Remondini, Daniel, Network measures for protein folding state discrimination, «SCIENTIFIC REPORTS», 2016, 6, Article number: 30367, pp. 1 - 8 [articolo]Open Access

Martello, Marina; Remondini, Daniel; Borsi, Enrica; Santacroce, Barbara; Procacci, M.; Pezzi, Annalisa; Dico, F. A.; Martinelli, Giovanni; Zamagni, Elena; Tacchetti, Paola; Pantani, Lucia; Testoni, Nicoletta; Marzocchi, Giulia; Rocchi, Serena; Zannetti, BEATRICE ANNA; Mancuso, Katia; Cavo, Michele; Terragna, Carolina, Opposite activation of the Hedgehog pathway in CD138+ plasma cells and CD138-CD19+ B cells identifies two subgroups of patients with multiple myeloma and different prognosis, «LEUKEMIA», 2016, 30, pp. 1869 - 1876 [articolo]

do Valle, Ítalo Faria; Giampieri, Enrico; Simonetti, Giorgia; Padella, Antonella; Manfrini, Marco; Ferrari, Anna; Papayannidis, Cristina; Zironi, Isabella; Garonzi, Marianna; Bernardi, Simona; Delledonne, Massimo; Martinelli, Giovanni; Remondini, Daniel; Castellani, Gastone, Optimized pipeline of MuTect and GATK tools to improve the detection of somatic single nucleotide polymorphisms in whole-exome sequencing data, «BMC BIOINFORMATICS», 2016, 17, Article number: 341, pp. 27 - 35 [articolo]Open Access

Simkó, Myrtill; Remondini, Daniel; Zeni, Olga; Scarfi, Maria Rosaria, Quality matters: Systematic analysis of endpoints related to “cellular life” in vitro data of radiofrequency electromagnetic field exposure, «INTERNATIONAL JOURNAL OF ENVIRONMENTAL RESEARCH AND PUBLIC HEALTH», 2016, 13, Article number: 701, pp. 701 - 716 [articolo]

Sala, Claudia; Vitali, Silvia; Giampieri, Enrico; do Valle, Ìtalo Faria; Remondini, Daniel; Garagnani, Paolo; Bersanelli, Matteo; Mosca, Ettore; Milanesi, Luciano; Castellani, Gastone, Stochastic neutral modelling of the Gut Microbiota's relative species abundance from next generation sequencing data, «BMC BIOINFORMATICS», 2016, 17, pp. 16 - 25 [articolo]Open Access

Castellani, Gastone C.; Menichetti, Giulia; Garagnani, Paolo; Bacalini, Maria Giulia; Pirazzini, Chiara; Franceschi, Claudio; Collino, Sebastiano; Sala, Claudia; Remondini, Daniel; Giampieri, Enrico; Mosca, Ettore; Bersanelli, Matteo; Vitali, Silvia; Do Valle, Italo Faria; Liò, Pietro; Milanesi, Luciano, Systems medicine of inflammaging, «BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS», 2016, 17, Article number: bbv062, pp. 527 - 540 [articolo]Open Access

Terragna, Carolina; Remondini, Daniel; Martello, Marina; Zamagni, Elena; Pantani, Lucia; Patriarca, Francesca; Pezzi, Annalisa; Levi, Giuseppe; Offidani, Massimo; Proserpio, Ilaria; De Sabbata, Giovanni; Tacchetti, Paola; Cangialosi, Clotilde; Ciambelli, Fabrizio; Viganò, Clara Virginia; Dico, Flores Angela; Santacroce, Barbara; Borsi, Enrica; Brioli, Annamaria; Marzocchi, Giulia; Castellani, Gastone; Martinelli, Giovanni; Palumbo, Antonio; Cavo, Michele, The genetic and genomic background of multiple myeloma patients achieving complete response after induction therapy with bortezomib, thalidomide and dexamethasone (VTD), «ONCOTARGET», 2016, 7, pp. 9666 - 9679 [articolo]

Bacalini MG; Boattini A; Gentilini D; Giampieri E; Pirazzini C; Giuliani C; Fontanesi E; Remondini D; Capri M; Del Rio A; Luiselli D; Vitale G; Mari D; Castellani G; Di Blasio AM; Salvioli S; Franceschi C; Garagnani P., A meta-analysis on age-associated changes in blood DNA methylation: Results from an original analysis pipeline for Infinium 450k data, «AGING», 2015, 7, pp. 97 - 109 [articolo]Open Access

Simonetti, Giorgia; Padella, Antonella; FARIA DO VALLE, Italo; Manfrini, Marco; Papayannidis, Cristina; Baldazzi, Carmen; Fontana, MARIA CHIARA; Guadagnuolo, Viviana; Ferrari, Anna; Zago, Elisa; Garonzi, Marianna; Bernardi, Simona; Ottaviani, Emanuela; Astolfi, Annalisa; Abbenante, Mariachiara; Marconi, Giovanni; Soverini, Simona; Cavo, Michele; Testoni, Nicoletta; Ferrarini, Alberto; Delledonne, Massimo; Haferlach, Torsten; Remondini, Daniel; Iacobucci, Ilaria; Martinelli, Giovanni, A Specific Pattern of Somatic Mutations Associates with Poor Prognosis Aneuploid Acute Myeloid Leukemia: Results from the European NGS-PTL Consortium, «BLOOD», 2015, 126, pp. 3840 - 3840 [abstract]

Giampieri, Enrico; De Cecco, Marco; Remondini, Daniel; Sedivy, John; Castellani, Gastone, Active degradation explains the distribution of nuclear proteins during cellular senescence, «PLOS ONE», 2015, 10, Article number: e0118442, pp. 1 - 25 [articolo]Open Access

Faria do Valle, Italo; Giampieri, Enrico; Padella, Antonella; Simonetti, Giorgia; Manfrini, Marco; Sala, Claudia; Vitali, Silvia; Martinelli, Giovanni; Remondini, Daniel; Castellani, Gastone ., An analysis pipeline for variant discovery in Whole Exome Sequencing data of cancer samples., in: Conference Proceedings 12th Bits Annual Meeting, 2015, pp. 100 - 101 (atti di: Conference Proceedings 12th Bits Annual Meeting, Milano, Italy, June 3-5 2015) [Contributo in Atti di convegno]

Ferrari, Anna; Di Rora, Andrea Chelli Luserna; FARIA DO VALLE, Italo; Garonzi, Marianna; Robustelli, Valentina; Maria Hernandez-Rivas, Jesus; Santoro, Alessandra; Pospisilova, Sarka; Haferlach, Torsten; Padella, Antonella; Simonetti, Giorgia; Papayannidis, Cristina; Abbenante, Mariachiara; Sazzini, Marco; Ferrarini, Alberto; Schira, Julien; Delledonne, Massimo; Castellani, Gastone; Remondini, Daniel; Martinelli, Giovanni, Clustering Adult ACUTE Lymphoblastic Leukemia (ALL) Philadelphia Negative (Ph-) By Whole Exome Sequencing (WES) Analysis, «BLOOD», 2015, 126, pp. 2623 - 2623 [abstract]

Simona Soverini, Caterina De Benedittis, Manuela Mancini, Michela Rondoni, Cristina Papayannidis, Antonella Padella, Giorgina Specchia, Roberta Zanotti, Livio Pagano, Viviana Guadagnuolo, Maria Chiara Fontana, Massimo Delledonne, Alberto Ferrarini, Italo Do Valle, Daniel Remondini, Gastone Castellani, Raffaele Calogero, Serena Merante, Chiara Elena, Peter Valent, Michele Cavo, Giovanni Martinelli, Genome-Wide Molecular Portrait of Aggressive Systemic Mastocytosis and Mast Cell Leukemia Depicted By Whole Exome Sequencing and Copy Number Variation Analysis, «BLOOD», 2015, 126, pp. 4085 - 4085 [abstract]

Fontana, MARIA CHIARA; Guadagnuolo, Viviana; Papayannidis, Cristina; Simonetti, Giorgia; Padella, Antonella; Ferrari, Anna; Manfrini, Marco; FARIA DO VALLE, Italo; Santacroce, Barbara; Perricone, Margherita; Marconi, Giovanni; Ottaviani, Emanuela; Feenstra, Jelena D. Milosevic; Chen, Doris; Them, Nicole C. C.; Soverini, Simona; Remondini, Daniel; Musuraca, Gerardo; Cavo, Michele; Kralovics, Robert; Martinelli, Giovanni, Genomic-Wide Analysis By High Resolution SNP Array Identifies Novel Genomic Alteration in Acute Myeloid Leukemia, «BLOOD», 2015, 126, pp. 2600 - 2600 [abstract]

Bacalini MG; Gentilini D; Boattini A; Giampieri E; Pirazzini C; Giuliani C; Fontanesi E; Scurti M; Remondini D; Capri M; Cocchi G; Ghezzo A; Del Rio A; Luiselli D; Vitale G; Mari D; Castellani G; Fraga M; Di Blasio AM; Salvioli S; Franceschi C; Garagnani P., Identification of a DNA methylation siganture in blood cells from persons with Down Syndrome., «AGING», 2015, 7, pp. 82 - 96 [articolo]Open Access

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