66626 - BIOCHIMICA DELLE PROTEINE

Conoscenze e abilità da conseguire

Al termine del modulo, lo studente conosce i meccanismi di produzione di energia per via fotosintetica, i principali sistemi che producono movimento in cellule, la regolazione del ciclo cellulare, i principali meccanismi di trasduzione del segnale e i meccanismi alla base della bioluminescenza.

Contenuti

• Gli aminoacidi: loro struttura; proprietà chimiche; proprietà acido base.
• Formazione del legame peptidico: struttura primaria delle proteine
• Struttura secondaria delle proteine: angoli diedri (phi; psi; omega; chi) e loro rappresentazione (diagramma di Ramachandran).
• Struttura ad elica (alfa-elica, elica pi-greco ed elica 3-10) e loro classificazioni geometriche e strutturali
• Foglietti beta; beta-hairpins; turns e loro classificazioni geometriche e strutturali
• Struttura terziaria delle proteine e classificazione in motivi e domini
• Struttura quaternaria delle proteine con alcuni esempi strutturali
• Motori molecolari
• Generalità sui motori molecolari - ATP e AAA
• ATP-Sintasi - Miosina
• Miosina - Dineina - Kinesina - Actina
• Actina e microtubuli
• Miosina/Actina e contrazione muscolare
• Dineina e microtubuli - Flagello batterico (cenni)
• Trasduzione del segnale
• G-Protein Coupled Receptors: Classificazione e struttura generale di GPCR; struttura dell'eterotrimero
• G-proteins; interazione ligando-recettore; attività GTPasica; bersaglio molecolare delle subunità;
• ProteinKinasiC Adenilato ciclasi
• Recettori con attività tirosin kinasica intrinseca - Sos-Ras-Raf
• Citochine e loro recettori
• Ormoni steroidei e loro recettori
• Ciclo cellulare
• Regolazione CDK-cicline (pRb) e loro interfaccia con i meccanismi di trasduzione del segnale
• Struttura dei complessi CDK-ciclina e interazione con E2F
• Regolazione attraverso INK4 (p16, p15, p18 e p19)  e CIP/KIP (p21, p27 e p57)
• Meccanismi fotofisici e biomolecolari e alla base del fenomeno della bioluminescenza e della Green Fluorescent Protein: cenni applicativi.
• Turn-over Proteine
• Meccanismi proteasici (proteasi a serina; protesai ad aspartato e metallo proteasi);
• Sistema Ubiquitina proteosoma; Calpaine;

Testi/Bibliografia

Biochimica di Jeremy M. Berg, John L. Tymoczko, Lubert Stryer - Zanichelli
Struttura e funzione delle proteine Gregory A Petsko, Dagmar Ringe - Zanichelli
Materiale fornito dal Docente disponibile on-line

Metodi didattici

Lezione Frontale

Modalità di verifica e valutazione dell'apprendimento

La valutazione finale è volta a definire il conseguimento dei seguenti obiettivi formativi:

- Conoscenza approfondita della struttura delle proteine

- Conoscere i processi:

• dei principali sistemi che producono movimento in cellule,
• della regolazione del ciclo cellulare,
• dei principali meccanismi di trasduzione del segnale

-  Capacità di applicare quanto appreso ad un caso proposto dal Docente

- Capacità di comunicare attraverso la preparazione di una presentazione da parte dello Studente (max 10 slides), in formato elettronico, su un argomento del programma a cui fa seguito una discussione nel merito

Strumenti a supporto della didattica

Il materiale didattico utilizzato a lezione è disponibile a questa pagina

Link ad altre eventuali informazioni

http://www.gsartor.org/pro/index.html

Orario di ricevimento

Consulta il sito web di Giorgio Sartor