B5786 - BIOMEDICAL DATA BASES

Conoscenze e abilità da conseguire

At the end of the course, the student acquires expertise in designing, implementing and curating data bases. The student will also be trained on the major biologically and medically oriented public data bases and how to retrieve and extract information for problem solving. Major tools accessible from specific data bases will be also utilized in order to facilitate information retrieval and data analysis.

Contenuti

Module 1 (2 CFU, 16 ore, docente: Prof. M. Paola Turina)

- Introduzione generale alle basi di dati biomediche.

- Panoramica su PubMed, UniProt, PDB, GenBank, Ensembl. Esempi di richiamo di informazioni da queste basi di dati. 

Module 2 (4 CFU, 32 ore, docente: Prof. Davide Salomoni)

- Introduzione alle basi di dati; struttura, contenuto, caratteristiche generali

- Basi di dati relazionali

- Basi di dati non-relazionali (comprese le basi di dati chiave-valore e a grafo)

- Inserimento a flusso di dati biologici nelle basi di dati

- Come interagire programmaticamente con le basi di dati: richiamo dei dati, annotazione e analisi

- Creare una propria base di dati

Testi/Bibliografia

Contenuti online e altre letture suggerite verranno indicati durante il corso. 

Metodi didattici

Lezioni frontali e attività pratiche.

Dato il tipo di attività e di metodi didattici, seguire il presente corso richiede la preliminare partecipazione di tutti gli studenti ai seguenti  Modules 1 and 2 in modalità e-learning:

Module 1 – Safety General Training

Module 2 – Safety Specific Training 

Modalità di verifica e valutazione dell'apprendimento

Un test scritto e una discussione orale.

Strumenti a supporto della didattica

Le diapositive di tutte le lezioni e delle sessioni pratiche saranno disponibili su virtuale.unibo.it

Orario di ricevimento

Consulta il sito web di Maria Paola Turina

Consulta il sito web di Davide Salomoni