Francesco Ravaioli
Curriculum vitae e dichiarazione altri incarichi ex D.lgs. n.33/2013

Curriculum Vitae (.doc 514.00KB)

ESPERIENZE LAVORATIVE

Marzo 2023 – ad ora

Ricercatore Sanitario
IRCCS Istituto delle Scienze Neurologiche di Bologna

via Altura, 3, 40139

Dicembre 2022 – Marzo 2023

Borsa di Studio
Blood-based biomarkers for Alzheimer's Disease in Down Syndrome: insights fromepigenetic, glycomic and inflammatory profiles

IRCCS Istituto delle Scienze Neurologiche di Bologna

via Altura, 3, 40139

Novembre 2019 – Novembre 2022

Assegnista di Ricerca

Università di Bologna

Dipartimento di Medicina Specialistica, Diagnostica e Sperimentale

Laboratorio di Immunologia – Ex Igiene

DIMES

Via S. Giacomo, 12, 40126

Attività Svolte

L’attività svolta durante questo periodo è stata centrata su tre progetti:

· studio dei profili di metilazione del DNA in soggetti euploidi di diversa età e persone con Sindrome di Down mediante l’utilizzo di tecniche di sequenziamento NGS,

· sviluppo di un saggio di sequenziamento bisulfito bersaglio per l’analisi dei profili di metilazione di elementi ripetuti del genoma,

· studio di biomarcatori di invecchiamento, basati sulla metilazione del DNA, in modelli murini di invecchiamento e di Sindrome di Down.

Le competenze tecniche acquisite includono:

· Utilizzo di software online per lo sviluppo di sequenze primer per lo studio della metilazione del DNA di elementi ripetuti del genoma

· Produzione di librerie (secondo l’approccio del sequenziamento bisulfito bersaglio) per il sequenziamento NGS su piattaforma Myseq Illumina

· Elaborazione di procedure per la manipolazione informatica del dato di sequenziamento e per l’estrazione del profilo di metilazione

· Sviluppo di procedure per l’analisi di rarefazione dei profili di metilazione (epiaplotipi) e per lo studio della composizione epiaplotipica dei campioni utilizzando indicatori di ricchezza di specie

Luglio 2016 – Ottobre 2016

Borsa di Studio

Studio delle modificazioni epigenetiche associate alla riprogrammazione e al differenziamento di fibroblasti da donatori anziani e longevi

Centro Interdipartimentale “L. Galvani”

via San Giacomo,12, 40126

Attività Svolte

Le attività svolte in questo periodo includono:

· Isolamento e coltivazione fibroblasti dermici primari da soggetti di diversa età e da soggetti con progeria

· Studio dei marcatori nucleari di senscenza (Lamin A) in fibroblasti provenienti da donatori di diversa età

· Studio dei profili di metilazione del DNA in fibroblasti dermici provenienti da soggetti di diversa età

ISTRUZIONE E FORMAZIONE

Ottobre 2016 – Novembre 2019

Dottorato in Oncologia, Ematologia e Patologia – XXXII° Ciclo

Università di Bologna
Dipartimento di Medicina Specialistica, Diagnostica e Sperimentale

Laboratorio di Immunologia – Ex Igiene
Via S.Giacomo, 12 - 40126 Bologna

Titolo Tesi

“Caratterizzazione di profili molecolari ed epigenetici in modelli di neurodegenerazione ed invecchiamento”

Attività svolte

L’attività svolta durante il dottorato è stata centrata sulla produzione di modelli cellulari per lo studio dei meccanismi di declino età-associato e l’identificazione delle alterazioni coinvolte nel passaggio da una condizione di deterioramento fisiologico alla manifestazione clinica della malattia di Parkinson.

L’attività di ricerca è stata svolta nel contesto del progetto europeo Propag-Ageing (H2020-EU.3.1.1., 2015-2019, Rif. 634821) con la collaborazione del Centro Interdipartimentale “Alma Climate” dell’Università di Bologna ed il Dipartimento di Medicina di Laboratorio del Karolinska Institute Huddinge di Stoccolma.

· Produzione e Caratterizzazione di cellule staminali indotte da fibroblasti dermici di soggetti centenari e pazienti affetti da Parkinson

· Applicazione ed ottimizzazione di protocolli di differenziamento e produzione di modelli cellulari di invecchiamento in vitro

· Produzione e caratterizzazione di modelli cellulari di tessuto nervoso (con specificazione dopaminergica)

· Ricapitolazione delle caratteristiche fisiopatologiche del Parkinson in modelli cellulari in vitro

· Applicazione di tecniche di next generation sequencing per l’analisi dei profili di metilazione del DNA e di espressione genica

· Utilizzo di software bioinformatici per la gestione e l’analisi di dati di sequenziamento

In parallelo, si è preso parte agli incontri periodici previsti nell’ambito del progetto europeo Propag-Ageing, dove è stato presentato il lavoro svolto.

Marzo 2016-Giugno 2016

Laureato Frequentatore

Laboratorio di Immunologia – Ex Igiene
DIMES
Via S.Giacomo, 12 - 40126 Bologna

Attività svolte

L’attività di ricerca svolta durante questo periodo è stata centrata attorno a due progetti sperimentali principali:

· Caratterizzazione e confronto dei profili di metilazione di fibroblasti dermici derivanti da individui centenari, iPSC generate da fibroblasti centenari e fibroblasti differenziati dalle sopra-menzionate cellule staminali. Valutazione di firme epigenetiche d’età e definizione dell’effetto della riprogrammazione sull’età cellulalre.

· Studio degli effetti della rapamicina su fibroblasti dermici derivanti da giovani, anziani e centenari mediante valutazione dell’ espressione e organizzazione delle lamine nucleari, della metilazione del DNA e della morfologia delle componenti citoplasmatiche della cellula.

Le competenze acquisite includono:

· Allestimento e trattamento farmacologico di colture celulari primarie

· Marcatura immunocitochimica volta alla valutazione delle lamine nucleari

· Analisi della morfologia delle componenti citoplasmatiche delle cellule mediante microscopia elettronica

· Valutazione dei profili di metilazione del DNA mediante Infinium MethylationEPIC 850k

· Utilizzo di pacchetti R per analisi di dati di metilazione

Parallelamente sono state svolte:

· Attività di supporto alla revisione e stesura di articoli scientifici

Aprile 2015 - Febbraio 2016

Erasmus Plus Mobilità per tirocinio

Karolinska Institute – Deprtment for Laboratory Medicine
H5, Division of Pathology, F46,
Karolinska Universitetssjukhuset, Huddinge
Stockholm, Sweden

Ottobre 2013 – Marzo 2016

Laurea Magistrale in Biotecnologie Farmaceutiche 110/110 L

Alma Mater Studiorum-Università di Bologna
Scuola di Biotecnologie, Farmacia e Scienze Motorie
Via Zamboni 33 – 40126 Bologna

Titolo Tesi

Use of Induced Pluripotent Stem Cells to model aging: how reprogramming affects centenarian cell biological age

Attività svolte

Durante i laboratori sono state svolte esperienze di:

· Immunoprecipitazione della cromatina

· Fermentazione Batch per la produzione di intermedi microbici di interesse farmacologico

· Allestimento di saggi di espressione eterologa per la produzione di vaccini

· Valutazione di silenziamento genico siRNA mediante saggi di gene reporter

L’attività di tirocinio è stata svolta presso le strutture del Karolinska Institute, Huddinge sotto la supervisione del Prof. Steven Strom. Durante questo periodo sono state acquisite le seguenti competenze:

· Riprogrammazione cellule somatiche adulte in cellule staminali indotte (iPSCs)

· Coltura cellule staminali indotte e staminali embrionali umane

· Coltura linee cellulari primarie di epatociti e fibroblasti dermici

· Valutazione di marcatori cellulari mediante qPCR, citofluorimetria di flusso e immunocitochimica.

· Valutazione di senescenza cellulare mediante saggio β-galattosidasi

L’attività di laboratorio è stata affiancata ad attività di referaggio di articoli scientifici, organizzazione di journal club ed c’è stata un’assidua partecipazione a conferenze ed eventi organizzati dal Karolinska Institute.

Giugno 2012-Luglio 2012

Biotechnology Summer School

University of Kent,
School of Biosciences

Canterbury, Kent, CT2 7NJ

Descrizione progetto

L’obiettivo della Summer School in Biotechnolgogy è stato quello di produrre proteine ricombinanti per il trattamento di patologie specifiche. In particolare, il progetto è incentrato nella sintesi di anticorpi per il trattamento della leucemia mieloide acuta.

Attività svolte

Durante la Summer School sono state svolte attività di laboratorio:

· Cultura cellulare di procarioti (E.Coli) ed eucarioti (P. Pastoris e CHO)

· Trasfezione

· Espressione di proteine ricombinante in un sistema ospite

· Purificazione proteica

· Caratterizzazione proteica

In più sono state svolte attività di preparazione di poster scientifici e presentazione del progetto di ricerca.

Referente

Dr. Dan Lloyd
School of Bioscience
D.Lloyd@kent.ac.uk [mailto:D.Lloyd@kent.ac.uk]

Ottobre 2010 – Luglio 2013

Laurea di 1° livello in Biotecnologie con votazione di 110/110 L

Alma Mater Studiorum-Università di Bologna
Scuola di Biotecnologie, Farmacia e Scienze Motorie
Via Zamboni 33 – 40126 Bologna

Titolo Tesi

Metilazione del DNA dei geni ELOVL2, FHL2 e PENK in fibroblasti dermici prelevati da individui giovani e centenari

Attività svolte

Durante i laboratori didattici curricolari è stata acquisita:

· Padronanza delle metodiche base di biologia molecolare: estrazione DNA/RNA/proteine, quantificazione spettrofotometrica di acidi nucleici/proteine, elettroforesi su gel di agarosio e poliacrilamide di acidi nucleici e analisi mediante tecnologia UV, saggi EMSA, Western e Southern Blot, amplificazione PCR

· Padronanza delle principali tecniche diagnostiche: immunocitochimica/immunoistochimica, costruzione di biosensori e utilizzo di saggi di quantificazione (enzimatici e immunometrici), ELISA

· Capacità nel gestire colture cellulari di linee immortalizzate e nell’utilizzare tecniche di citofluorimetria

Durante il periodo di tirocinio in preparazione alla tesi sono state approfondite metodiche di biologia molecolare avanzata ed epigenetica:

· Utilizzo della tecnica di PCR quantitativa per la quantificazione di trascritti

· Utilizzo della piattaforma Sequenom EpiTYPER per lo studio della metilazione del DNA

Settembre 2005 – Luglio 2010

Diploma di maturità

Liceo Scientifico “Fulcieri P. de Calboli”
Via Aldo Moro, 13

47121 Forlì (FC)

ATTIVITÀ DIDATTICHE

AA 2022-2023

• Titolare Corso. 66569 - DNA/RNA DYNAMICS (Modulo 2) - Laurea Magistrale in Bioinformatics (cod. 8020).

AA 2021-2022

• 8487-Tecniche della prevenzione nell'ambiente e nei luoghi di lavoro (abilitante alla professione sanitaria di tecnico della prevenzione nell'ambiente e nei luoghi di lavoro) - 75216 - Scienze della Prevenzione iv - (c.i.) - Patologia Generale (24 ore). Titolare Corso: Prof. Paolo Garagnani. Ore svolte: 4
• 8477-Educazione Professionale (abilitante alla professione sanitaria di educatore professionale) - 00768 - Scienze biologiche di base e applicate all'uomo ii (c.i.) - Patologia Generale (24 ore). Titolare Corso: Prof. Paolo Garagnani. Ore svolte: 4
• 8878-Scienze delle professioni sanitarie della prevenzione - 78843 - valutazione del rischio c.i. - Valutazione del Rischio (24 ore). Titolare Corso: Prof. Paolo Garagnani. Ore svolte: 4

ATTIVITA’ DI RICERCA

Partecipazione a Progetti nazionali e internazionali

01/09/2015-31/09/2019

H2020 -EU 3.1.1- PROPAG-AGING - The continuum between healthy ageing and idiopathic Parkinson Disease within a propagation perspective of inflammation and damage: the search for new diagnostic, prognostic and therapeutic targets (ref: 634821)

Metriche di Pubblicazione

N° Documenti: 19

Citazioni: 271

H-Index: 10

In data 02/03/2023 , ai sensi dell'art. 15 co. 1 lett. c) del D.lgs. n.33/2013, dichiaro di non svolgere incarichi, né di avere titolarità di cariche in enti di diritto privato regolati o finanziati dalla pubblica amministrazione, né di svolgere attività professionali.

 

In data 12/06/2023 , ai sensi dell'art. 15 co. 1 lett. c) del D.lgs. n.33/2013, dichiaro di svolgere incarichi e/o avere titolarità di cariche di diritto privato regolati o finanziati dalla pubblica amministrazione e/o svolgere attività professionali.

Ricercatore Sanitario (Cat. D Liv Super) presso Azienda USL di Bologna, IRCCS Istituto delle Scienze Neurologiche di Bologna, via Altura 3, 40139, Bologna dal 17/03/2023 sino al 16/03/2028.